蛋白質分子表面構建與靜電勢分析提綱
論文摘要: 蛋白質是生命的物質基礎,研究蛋白質分子具有重要的意義.這主要體現在:首先,蛋白質是細胞中的主要功能分子,大多數的生命功能都需要蛋白質來調控.（略）也是細胞中含量最為豐富的分子之一.因此,蛋白質分子的功能和結構的研究一直是生命科學研究的熱點.蛋白質分子結構決定其功能.特別的,分子表（略）結構對功能影響極大.另外,在研究蛋白質分子時,分析靜電勢場是一個主要的手段.本文從上述兩個方面對蛋白質進行分析（略）前人構建的蛋白質分子表面原子拓撲結構SASG的基礎上,本文提出了表面原子圖SAG的數據結構和相關算法,通過構建SAG并且搜索SAG的表面原子連通子圖,找到真正的表面原子,去掉了由于SASG計算所包含的一些多余的原子.在提取（略）礎上,構建了蛋白質分子的溶劑外部曲面(Solvent Excluded Surface, SES),結果表明用新的方法構建的SES更符合其定義.另外,我們把提取的表面原子還應用到搜索蛋白質分（略）問題的研究中,結果表明本文的方法是高效而且是有意義的. 本文還詳細的敘述了在研究結合態配體小分子的芳香環靜電勢能的發現.通過分析大量的已知復合物結構,我們發現芳香...
Protein plays a very crucial role i（omitted） studying pro（omitted）ular is important. First, proteins are the main functions of （omitted）ecules, most of the biological functions are regulated by protein molecular. Second, protein molecular is one of most abundant elements in cell. So the study of protein m（omitted）unctions and structure is one hot problem of life science. Protein molecular func（omitted）nd on its structure, especially, the surface atoms plays a very important role in its functions. In ad...
目錄:摘要 第5-6頁
Abstract 第6頁
第1章 緒論 第9-18頁
·蛋白質分子三維幾何結構 第9-13頁
·蛋白質分子四級結構 第9-10頁
·蛋白質分子結構獲取方法 第10-11頁
·蛋白質分子三維結構表示方法 第11-13頁
·蛋白質分子數據庫 第13頁
·蛋白質分子的靜電勢 第13-17頁
·靜電勢和靜電勢能的定義 第14-15頁
·蛋白質分子靜電勢的計算 第15-17頁
·本文的主要工作 第17頁
·本文的章節安排 第17-18頁
第2章 蛋白質分子表面原子的提取及應用 第18-38頁
·引言 第18頁
·蛋白質分子表面原子的定義和拓撲結構 第18-21頁
·蛋白質分子表面的定義 第18-19頁
·蛋白質分子表面原子的定義 第19頁
·拓撲結構 第19-21頁
·蛋白質分子表面原子圖(SAG-surface atoms graphic) 第21-25頁
·分子表面原子圖SAG的定義 第21-22頁
·分子表面原子圖SAG的構建 第22-24頁
·分子表面原子圖SAG的搜索 第24-25頁
·分子內空腔例子的展示 第25-27頁
·實驗結果 第27-28頁
·表面原子在構建分子表面中的應用 第28-29頁
·表面原子在分子靜電勢場分析中的應用 第29-30頁
·表面原子在蛋白質對生物材料表面吸附中的應用 第30-37頁
·馬爾科夫鏈Monte Carlo(MCMC)簡介 第31-34頁
·搜索蛋白質分子吸附取向的方法 第34-35頁
·蛋白質分子吸附取向的實驗結果 第35-37頁
·討論 第37頁
·本章小結 第37-38頁
第3章 蛋白質分子結合位點靜電勢特征分析 第38-56頁
·引言 第38頁
·靜電勢的應用 第38-40頁
·本文方法 第40-43頁
·實驗結果 第43-54頁
·例子展示 第44-52頁
·protein-DNA實驗結果 第52-54頁
·討論 第54-55頁
·本章小結 第55-56頁
第4章 總結與展望 第56-58頁
·總結 第56-57頁
·展望 第57-58頁
參考文獻 第58-62頁
致謝 第62頁
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