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      達坂鹽湖沉積土壤嗜鹽細菌的多樣性分析及鈉離子輸出相關(guān)基因的克

      時間:2024-10-20 10:55:26 論文提綱 我要投稿

      達坂鹽湖沉積土壤嗜鹽細菌的多樣性分析及鈉離子輸出相關(guān)基因的克

            論文摘要: 嗜鹽菌由于具有廣泛的環(huán)境(略)系統(tǒng)發(fā)育多樣性、獨特的耐鹽機制和潛在應用價值,近年來受到科學界的廣泛關(guān)注.本研究以新疆達坂鹽湖沉積土壤為實驗材料,對新疆達坂鹽湖的嗜鹽細菌進行多樣性分析,并從中克隆獲得1個新的鈉離子輸出相關(guān)基因.主要研究結(jié)論如下: 以選擇性富集培養(yǎng)獲得的嗜鹽細菌基因組DNA為模板,擴增16S rRNA基因,在此(略)鹽細菌的16S rRNA基因文庫,隨機挑選文庫中的100個陽性克隆子進行群落結(jié)構(gòu)多樣性分析.16S rRNA基因序列分析結(jié)果表明:100個克隆分屬于細菌域9個屬的27個種,其中芽(略)cillus)為優(yōu)勢菌群(48%),喜鹽芽孢桿菌(Halobacillus) (14%)、嗜鹽單胞菌(Halomonas) (13%)為次優(yōu)勢菌群.分析的陽性克隆子中(略)子與GenBank中已報道16S rRNA基因序列的相似性在88.80%到96.90%之間,可能代表新屬或新種.研究結(jié)果表明,新疆達坂鹽湖沉積土壤的富集培養(yǎng)物中存在種類較為豐富的嗜鹽細菌. 以大腸桿菌Na+/H+逆向轉(zhuǎn)運蛋白基因缺陷株Escheric(略)li KNabc為宿主,...
             Halophiles living in high-salt environment, due to a wide diversity of environmental(omitted)n, phylogenetic diversity, uniqu(omitted)erance mechanisms and potential applica-tions in recent years widespread attention by the scientific community. In this study, Daban(omitted) in Xinjiang as materials deposited s(omitted)er to obtain directional halophilic microorganisms enriched total DNA as a template of the Daban salt(omitted)injiang diversity of halophilic bacteria, and a new sodium ion output ...
      目錄:摘要 第4-5頁
      Abstract 第5頁
      目錄 第6-9頁
      1 序言 第9-26頁
        ·極端微生物簡介 第9-11頁
          ·極端微生物的主要生物類群 第9-10頁
            ·嗜熱微生物和嗜冷微生物 第9頁
            ·嗜酸微生物和嗜堿微生物 第9-10頁
            ·嗜鹽微生物 第10頁
            ·嗜壓微生物 第10頁
          ·極端微生物的應用 第10-11頁
        ·嗜鹽菌的研究概況 第11-16頁
          ·嗜鹽菌的定義和分類 第11-12頁
          ·嗜鹽菌棲息的鹽域環(huán)境 第12頁
          ·嗜鹽古菌的研究歷史 第12頁
          ·中度嗜鹽菌的研究歷史 第12-13頁
          ·嗜鹽菌的研究熱點 第13-16頁
            ·嗜鹽菌的分類學 第13頁
            ·嗜鹽菌的系統(tǒng)發(fā)育多樣性 第13-14頁
            ·嗜鹽菌的應用 第14-16頁
            ·嗜鹽菌的生理學 第16頁
        ·嗜鹽微生物的鹽適應機制 第16-23頁
          ·通過提高胞質(zhì)緩沖力來適應高鹽環(huán)境 第17頁
          ·次級鈉泵系統(tǒng) 第17-23頁
            ·大腸桿菌中的Na~+/H~+逆向轉(zhuǎn)運蛋白 第17-20頁
            ·耐鹽菌和嗜鹽菌中的Na~+/H~+逆向轉(zhuǎn)運蛋白 第20-21頁
            ·嗜堿菌中的Na~+/H~+逆向轉(zhuǎn)運蛋白 第21頁
            ·其它類型微生物中的Na~+/H~+逆向轉(zhuǎn)運蛋白 第21-22頁
            ·NhaD Na~+/H~+逆向轉(zhuǎn)運蛋白 第22-23頁
        ·Na~+/H~+逆向轉(zhuǎn)運蛋白的應用前景 第23頁
        ·微生物Na~+/H~+逆向轉(zhuǎn)運蛋白亟待研究的問題 第23-24頁
        ·本研究的指導思想、目的和意義 第24頁
        ·本研究的技術(shù)路線 第24-26頁
      2 新疆達坂鹽湖沉積土壤嗜鹽細菌的多樣性分析 第26-37頁
        ·材料和方法 第26-31頁
          ·樣品的采集和處理 第26頁
          ·主要儀器和實驗用品 第26頁
          ·菌株和載體 第26頁
          ·培養(yǎng)基 第26-27頁
          ·主要試劑 第27頁
            ·DNA提取試劑 第27頁
            ·電泳相關(guān)緩沖液 第27頁
          ·實驗方法 第27-31頁
            ·嗜鹽菌的定向富集 第27-28頁
            ·總基因組DNA的提取與純化 第28頁
            ·DNA濃度和純度的測定 第28頁
            ·PCR反應體系和條件 第28-29頁
            ·PCR產(chǎn)物的純化 第29頁
            ·連接 第29-30頁
            ·熱激感受態(tài)的制備 第30頁
            ·熱激轉(zhuǎn)化 第30頁
            ·菌落PCR 第30頁
            ·DNA序列測定 第30頁
            ·S rRNA的系統(tǒng)發(fā)育分析 第30-31頁
            ·核苷酸序列登錄號 第31頁
        ·結(jié)果與分析 第31-36頁
          ·總基因組DNA的提取 第31頁
          ·嗜鹽富集培養(yǎng)物16S rRNA基因多樣性及其系統(tǒng)發(fā)育分析 第31-36頁
            ·嗜鹽富集培養(yǎng)物16S rRNA基因系列擴增 第31-32頁
            ·嗜鹽富集培養(yǎng)物16S rRNA基因克隆文庫的構(gòu)建與多樣性分析 第32-36頁
        ·討論 第36-37頁
      3 微生物鈉離子輸出相關(guān)基因的克隆與功能研究 第37-55頁
        ·材料與方法 第37-43頁
          ·樣品的采集和處理 第37頁
          ·菌株、質(zhì)粒和引物 第37-38頁
          ·主要儀器和實驗用品 第38頁
          ·培養(yǎng)基 第38頁
          ·堿法提取質(zhì)粒所需主要試劑 第38頁
          ·實驗方法 第38-43頁
            ·總基因組DNA提取、純化及濃度測定 第38頁
            ·總基因組DNA的部分酶切 第38-39頁
            ·載體的酶切和去磷酸化 第39頁
            ·載體與總基因組DNA部分酶切片段的連接 第39-40頁
            ·連接產(chǎn)物純化 第40頁
            ·電轉(zhuǎn)化感受態(tài)細胞的制備 第40-41頁
            ·電激轉(zhuǎn)化 第41頁
            ·質(zhì)粒的快速檢測 第41頁
            ·質(zhì)粒提取 第41-42頁
            ·鈉離子輸出相關(guān)基因的亞克隆 第42-43頁
            ·基因序列的生物信息學分析 第43頁
            ·重組子在不同條件下的生長能力測試 第43頁
        ·結(jié)果和分析 第43-53頁
          ·總基因組DNA的部分酶切 第43-44頁
          ·陽性克隆子的篩選 第44頁
          ·重組質(zhì)粒攜帶外源基因的序列分析 第44-51頁
          ·Na~+輸出相關(guān)基因的亞克隆 第51-52頁
          ·E.coli KNabc/pMDtetR-smrL的耐鹽性實驗 第52頁
          ·E.coli KNabc/pMDtetR-smrL對堿性pH的抗性 第52-53頁
        ·討論 第53-55頁
      結(jié)論 第55-56頁
      參考文獻 第56-65頁
      縮略詞一覽表 第65-66頁
      致謝 第66-67頁
      項目資助與論文發(fā)表情況 第67頁

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